Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Setd4P58467 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Setd4P58467 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms