Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp20P57748 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms