Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Usp25P57080 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Usp25P57080 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms