Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bace1P56818 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms