Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Atp5eP56382 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Atp5eP56382 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Atp5eP56382 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Atp5eP56382 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Atp5eP56382 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Atp5eP56382 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Atp5eP56382 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Atp5eP56382 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms