Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1P55194 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms