Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa8P50706 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa8P50706 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa8P50706 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa8P50706 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa8P50706 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa8P50706 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa8P50706 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa8P50706 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa8P50706 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa8P50706 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa8P50706 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa8P50706 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa8P50706 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa8P50706 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa8P50706 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa8P50706 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa8P50706 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa8P50706 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Defa8P50706 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms