Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms