Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms