Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CitP49025 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CitP49025 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CitP49025 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms