Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rplp1P47955 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rplp1P47955 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rplp1P47955 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rplp1P47955 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rplp1P47955 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rplp1P47955 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rplp1P47955 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rplp1P47955 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rplp1P47955 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rplp1P47955 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rplp1P47955 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rplp1P47955 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rplp1P47955 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rplp1P47955 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rplp1P47955 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms