Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gli1P47806 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms