Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms