Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc11P31313 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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