Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms