Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms