Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BrafP28028 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BrafP28028 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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BrafP28028 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BrafP28028 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BrafP28028 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BrafP28028 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BrafP28028 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BrafP28028 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BrafP28028 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BrafP28028 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BrafP28028 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BrafP28028 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BrafP28028 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BrafP28028 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BrafP28028 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BrafP28028 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BrafP28028 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BrafP28028 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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