Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms