Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms