Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RarbP22605 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RarbP22605 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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