Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms