Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms