Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Csn1s1P19228 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms