Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RargP18911 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RargP18911 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RargP18911 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RargP18911 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RargP18911 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RargP18911 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RargP18911 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms