Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18533 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P18533 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18533 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18533 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms