Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18528 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18528 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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