Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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