Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms