Protein–RNA interactions for Protein: P16381

D1Pas1, Putative ATP-dependent RNA helicase Pl10, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D1Pas1P16381 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D1Pas1P16381 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D1Pas1P16381 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms