Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrphP15331 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrphP15331 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrphP15331 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrphP15331 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrphP15331 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrphP15331 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrphP15331 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrphP15331 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrphP15331 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrphP15331 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrphP15331 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrphP15331 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms