Protein–RNA interactions for Protein: P12970

Rpl7a, 60S ribosomal protein L7a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl7aP12970 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl7aP12970 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl7aP12970 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl7aP12970 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl7aP12970 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl7aP12970 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl7aP12970 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl7aP12970 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl7aP12970 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl7aP12970 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl7aP12970 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl7aP12970 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl7aP12970 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl7aP12970 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms