Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms