Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms