Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms