Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaraP11416 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaraP11416 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RaraP11416 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RaraP11416 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RaraP11416 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RaraP11416 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RaraP11416 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RaraP11416 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RaraP11416 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RaraP11416 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RaraP11416 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RaraP11416 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RaraP11416 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RaraP11416 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RaraP11416 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RaraP11416 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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