Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sub1P11031 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sub1P11031 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sub1P11031 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sub1P11031 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sub1P11031 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sub1P11031 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sub1P11031 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sub1P11031 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sub1P11031 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sub1P11031 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sub1P11031 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Sub1P11031 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Sub1P11031 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Sub1P11031 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Sub1P11031 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Sub1P11031 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sub1P11031 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sub1P11031 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sub1P11031 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sub1P11031 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sub1P11031 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms