Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PolP10400 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PolP10400 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PolP10400 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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