Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprqP0C5E4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms