Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col3a1P08121 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col3a1P08121 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms