Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms