Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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TtrP07309 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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TtrP07309 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TtrP07309 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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TtrP07309 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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TtrP07309 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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