Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Me1P06801 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Me1P06801 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Me1P06801 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Me1P06801 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Me1P06801 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Me1P06801 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Me1P06801 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Me1P06801 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Me1P06801 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Me1P06801 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms