Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc4a1P04919 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms