Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P04213 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P04213 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P04213 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
P04213 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P04213 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P04213 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P04213 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P04213 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P04213 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P04213 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P04213 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04213 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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