Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01797 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01797 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01797 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01797 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01797 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01797 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01797 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01797 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01797 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01797 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01797 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01797 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01797 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01797 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms