Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01644 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01644 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01644 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01644 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01644 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01644 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01644 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01644 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01644 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01644 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01644 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01644 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01644 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01644 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01644 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01644 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01644 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01644 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01644 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01644 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01644 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01644 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01644 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01644 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01644 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01644 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01644 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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P01644 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01644 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01644 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01644 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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