Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BlmO88700 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BlmO88700 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BlmO88700 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BlmO88700 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BlmO88700 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BlmO88700 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BlmO88700 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BlmO88700 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BlmO88700 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BlmO88700 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BlmO88700 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BlmO88700 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BlmO88700 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BlmO88700 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BlmO88700 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms