Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shoc2O88520 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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