Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms