Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SlkO54988 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SlkO54988 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms